Craig’in en büyük tutkusu kuklacılıktır ancak bu yeteneği ona istikrarlı bir yaşam sunmaz. Maddi sorunlarla boğuşurken bir şirkette işe giren Craig, burada hem Maxine adlı gizemli bir kadınla tanışır hem de sırlarla dolu bir kapının varlığını öğrenir. Kapının ardında ise inanılması güç bir deneyim vardır: John Malkovich’in bedenine kısa süreliğine geçebilmek. Bu keşif, Craig’in hayallerini, arzularını ve gerçeklik algısını tamamen değiştirecektir.